Masalah ini biasanya terjadi ketika Anda meng-upgrade versi Cpanel. Untuk mengatasi masalah ini ikuti langkah-langkah yang diberikan di bawah ini:-
1) Pertama, Anda perlu memeriksa izin untuk file/usr/local/cpanel/3rdparty/bin/php
/usr/local/cpanel/3rdparty/bin/php-cgi
2) Di atas kedua file harus memiliki izin 755, Jika bukan izin 755 maka ubah izin menjadi 755.
3) Setelah izin diubah, jalankan perintah di bawah ini dari shell/scripts/makecpphp
Sekarang Anda tidak akan menerima phpMyAdmin “500 internal server error”.