Saya berhasil memperbaiki momen ini setelah memposting pertanyaan.
Ternyata /etc/shadow entri untuk pengguna kata sandi MD5 yang terpengaruh entah bagaimana memiliki bidang setelah kata sandi hash digandakan, menyebabkan PAM tidak dapat menafsirkan baris. Dengan kata lain, pekerjaan potong dan tempel yang buruk.
Saya belum cukup minum kopi...